Genóm živé fosílie odhaliť tajomstvo extrémnej prežitie

Vo vývoji niektorých druhov organizmov postupne nahradená inou. Mnohí idú do zabudnutia, ale tam sú tí, ktorí sú relatívne málo zmien v priebehu celého milión rokov až po súčasnosť. Taká dlhovekosť je nazývaný žijúci fosílie, a dôvody ich evolučnej úspech s veľkou horlivosťou vedci sa snažia riešiť. Jedným z nich je ginko strom - nahosemenných reliktné rastlina, ktorá rastie v Číne.

Fossil ginkgo list, čo je asi 49.000.000 rok, prakticky nijako nelíši od moderného príbuzného.
Foto Ninjatacoshell, CC BY-SA via Wikimedia Commons.

V súčasnej dobe je rodina gingkovyh, predstavoval iba jeden rod, v ktorom je tam len jeden pohľad - Ginkgo biloba (Ginkgo biloba). Zároveň existujú skamenené vzorky príbuzných druhov, ktoré patria do obdobia permu a datujú 270 miliónov rokov. V jeho rozkvetu, a to v polovici Jurassic obdobia, rodina mala asi 15 rodov.

Životaschopnosť ginkgo jedinečné. Jeden z najnápadnejších Dokladom toho je skutočnosť, že tieto stromy sú jedným z mála živočíchov, ktorí prežili výbuch atómovej bomby v japonské mesto Hirošimu v roku 1945.

Pravdepodobne tie isté vlastnosti im umožnilo prežiť obdobie zaľadnenia v zemskej histórii, ktorý zničil mnoho ďalších druhov rastlín. Navyše, ginkgo vylučujú rad chemických látok na ochranu proti hmyzu, húb a baktérií.

Ak sa chcete dozvedieť tajomstvo prírody, nie je priamejšie spôsob, ako genómu. To je to, čo sa deje s gingko tím čínskych vedcov z Pekingu Genomics Institute (BGI), Chzheytszyanskogo University (Zheijiang univerzita) a Čínskej akadémie vied (CAS).

Úlohou nebolo jednoduché a požadované úsilia mnohých odborníkov, ako aj určité technické schopnosti ako genóm tohto jedinečného závodu obsahuje viac ako 10 miliárd párov báz (pre porovnanie, ľudský genóm obsahuje "iba" ako tri miliardy bázových párov). Iba také množstvo prijatých surových dát trvalo dva terabajty pamäte. Výskumníci veria, že takáto veľká veľkosť môže byť výsledkom úplné zdvojenie genómu rastliny.

Jedným z úžasných vlastností tejto sekvencie bola extrémne vysoké percento opakovaných pozemkov - 76,58%, ktoré predtým neboli pozorované v žiadnom z iných druhov.

Kladie dôraz na jedinečnosť ginkgo a jeho miesto v evolučnom stromu rastlín. V oficiálnej tlačovej správe, štúdie profesor Zhao Yunpen (Yunpeng Zhao), hovorí, že ginkgo je jedným z piatich momentálne existujúcich oddeleniach semenných rastlín a nemá žiadne žijúci príbuzných.

Čítanie genómu - prvý krok k popisu všetkých tajomstiev prírody. Teraz pred vedcov je obrovský untilled pole, kde strávia viac ako jeden rok. Je pravdepodobné, že výsledkom ich práce bude popisovať unikátny molekulárne mechanizmy rastlinného prežitie, ktoré pomôžu, okrem iného, ​​na kŕmenie ľudstvo v budúcnosti.

Článok s prvými výsledkami štúdie uverejnenej v edícii GigaScience.